判官：民部丞（みんぶのじょう）#民部大夫（みんぶのたゆう）
治部省：处理外交事务、高官的户籍管理、监督寺社佛阁等处人员的礼仪，也裁判庶民的婚姻诉讼。石田三成叙任治部少辅之事非常有名。
長官：治部卿（じぶきょう）
次官：治部大輔（じぶたいふ）#治部少輔（じぶのしょう）
判官：治部丞（じぶのじょう）
兵部省：管理武官的人事、诸国的兵马、城池等一切军务的部门，负责录用京和地方的兵士，制成名簿。大内义隆叙任兵部卿。
長官：兵部卿（ひょうぶきょう）
次官：兵部大輔（ひょうぶたいふ）#兵部少輔（ひょうぶのしょう）
判官：兵部丞（ひょうぶのじょう）
刑部省：管理诉讼的审理、判决、刑罚执行的部门，后因为检非违使厅的崛起，职权旁移，成为有名无实的官职。大谷吉继叙任刑部少辅一职。
長官：刑部卿（ぎょうぶきょう）
次官：刑部大輔（ぎょうぶたいふ）#刑部少輔（ぎょうぶのしょう）
判官：刑部丞（ぎょうぶのじょう）
一级能力测试
大藏省：管理诸官厅的收支、诸国的调（田地课税）、货币、金银、物价的部门。
長官：大蔵卿（おおくらきょう）
次官：大蔵大輔（おおくらたいふ）#大蔵少輔（おおくらのしょう）
判官：大蔵丞（おおくらのじょう）#大蔵大夫（おおくらのたゆう）
宫内省：总管皇室的收支、衣食、杂务等宫中之事，同时也兼管诸国献上的食料和御料地（皇室直辖领）。
長官：宮内卿（くないきょう）
次官：宮内大輔（くないたいふ）#宮内少輔（くないのしょう）
判官：宮内丞（くないのじょう）
三、职
京职：担当京的租税、商业、道路等民政事务以及司法、警察之事的部门，分左右两部，各自担当东西两半。后来因职权移至检非违使厅而丧失权力。向往京的伊达氏、佐竹氏等诸多东北大名自称京职，陆奥的岩城重隆叙任左京大夫，津轻为信叙任右京大夫。
長官：左京大夫（さきょうだいぶ）#右京大夫（うきょうだいぶ）
次官：左京亮（さきょうのすけ）#右京亮（うきょうのすけ）
判官：左京進（さきょうのじょう）#右京進（うきょうのじょう）
修理职：与木工寮分头管理宫殿的修理和营造的部门。织田信长上洛之际，为柴田胜家申请了修理亮一职。后来秀吉的家臣蜂须贺正胜叙任修理大夫，青山宗胜叙任修理亮一职。
長官：修理大夫（しゅりだいぶ）
次官：修理亮（しゅりのすけ）
判官：修理進（しゅりのじょう）
大膳职：负责在典礼上分配、调理款待臣下宴席的部门，也负责管理诸国献上的食物。武田信玄叙任大膳大夫一职。
長官：大膳大夫（だいぜんだいぶ）
次官：大膳亮（だいぜんのすけ）
判官：大膳進（だいぜんのじょう）
四、春宫坊
春宫坊：负责皇太子饮食起居一切事务的部门。春宫大夫由皇太子命令封职，管理宫殿。下部组织有主膳监、主马署、主殿署。
長官：春宮大夫（とうぐうだいぶ）
次官：春宮亮（とうぐうのすけ）
判官：春宮進（とうぐうのじょう）
主膳监：负责调理皇太子饮食的部门，主膳正还要负责尝毒。后因为内膳司兼了其职，遂无叙任者。
長官：主膳正（しゅぜんのかみ）
判官：主膳佑（しゅぜんのじょう）
主马署：管理东宫马匹、马具的部门。秀吉的家臣松野重元叙任主马首一职。
長官：主馬首（しゅめのかみ）
主殿署：负责东宫扫除、入浴准备的部门。